يكمن دور وزارة المالية في المراحل الأولى والمعنية بدارسة الوضع الحالي وتحليل الفجوات ومن ثم المرحلة الثانية، المتعلقة بالتخطيط والتصميم وإعداد خطة التحول، ويكون دور الوزارة في المرحلتين الثالثة والرابعة من المشروع الإشراف والدعم وتقديم الاستشارات من خلال مركز الاتصال والدعم لتحول الجهات الحكومية، ويتمثل دور هذه الجهات ومسؤوليتها في المرحلة الثالثة من عمر المشروع بالإعداد والتجهيز للتحول ومن ثم التطبيق الفعلي ومسك السجلات المحاسبية بشكل يومي وفقاً لأساس الاستحقاق خلال المرحلة الرابعة.