استناداً إلى نظام الممثلين الماليين الصادر بالمرسوم الملكي رقم (م/85) بتاريخ 20/9/1380هـ، تتولى وزارة المالية الرقابة المباشرة على عمليات الصرف والإيراد، وسعياً منها لرفع كفاءة وفاعلية أنظمة الرقابة الداخلية في الجهات المستهدفة، ضمّنت الوزارة أساليب رقابية تطبق على هذه الجهات، بما يتناسب مع طبيعتها واستقلاليتها وكفاءتها الرقابية، وهي الرقابة الذاتية، والرقابة الرقمية والتقنية، ورقابة التقارير.